Tengo varias 1099 como contratista (bajo mi nombre) independiente pero tambien tengo una LLC y algunos ingresos a traves de esa LLC. Debo hacer una declaracion o dos?

A menos que haya hecho una elección de que su LLC sea considerado como una corporación (ya se corporación-S o corporacíón-C), todos sus ingresos serán declarados como una sola empresa, a menos que el estado donde viva exiga que los ingresos para el LLC se declaran por separado.  En ese caso, haría un Anexo C con lo que ganó como individuo que no estaba en nombre del LLC, y otro con lo que ganó bajo el LLC.  Los gastos de la empresa igualmente se tendrían que dividir entre lo que se gastó fuera del LLC y lo que gastó dentro.  Y, para la declaración Federal, tendrá el mismo resultado final.  Pero puede que el estado suyo necesita ver la clara división.

Recuerde que un LLC es considerado como una entitad no considerada en sentido tributario a los ojos del IRS.  Significa que tener el LLC mismo no cambia como hay que pagar tributo a esos ingresos.  Pero sí es una entitad legal del estado, y el estado puede tener ciertos requisitos al respeto.